Vaccinuri personalizate impotriva cancerului, partea a 2-a: tesutul de care ai nevoie -- si de ce sa-l asiguri devreme

Pe scurt: Ăsta e un text care continuă articolul meu principal despre vaccinurile personalizate împotriva cancerului . Acela era despre care vaccin s-ar putea potrivi cu biologia mea. Ăsta e despre un lucru mult mai de bază, care era cât pe ce să mă oprească înainte ca biologia să conteze măcar: țesutul. Un vaccin personalizat poate avea nevoie de mult mai mult material tumoral decât testul care te-a diagnosticat prima dată – adesea proaspăt congelat, nu parafină – iar dacă tratamentul funcționează bine, s-ar putea să nu mai rămână nimic de biopsiat atunci când, în sfârșit, ai nevoie. Scriu asta pentru că mi-aș fi dorit să-mi fi spus cineva la prima biopsie. Poate ajunge la tine înaintea biopsiei tale.

Ce mi s-a întâmplat

Țesutul meu tumoral a fost recoltat o singură dată, la diagnostic, printr-o biopsie cu ac – două carote mici. A fost destul cât să diagnosticheze cancerul și să ruleze un panel molecular mare. Părea din belșug.

Luni mai târziu, urmărind un vaccin personalizat, am cerut laboratorului care îmi ține blocurile de parafină să măsoare cât a mai rămas, de fapt. Răspunsul, de la anatomopatologul care a pus blocurile sub microscop: mai puțin de un milimetru de țesut per bloc – un estimat de trei până la cinci secțiuni subțiri din fiecare. Nu destul pentru ce cere un centru de vaccinuri. Cea mai sigură cale de a obține mai mult, mi-a scris, ar fi o nouă biopsie.

Numai că nu pot face o nouă biopsie. Tratamentul meu a mers atât de bine încât nu mai există tumoră care să fie sigură sau logică de recoltat – nimic destul de mare, destul de activ sau destul de accesibil pentru un ac. Exact lucrul care îmi face situația plină de speranță e același lucru care a închis ușa către țesut nou.

Asta e capcana într-o singură propoziție: țesutul pe care îl poți obține devreme ar putea fi singurul pe care îl vei obține vreodată.

De ce un vaccin are nevoie de mult mai mult țesut decât un diagnostic

Un panel diagnostic de rutină e eficient. Citește o listă definită de gene ale cancerului, în profunzime, dintr-o cantitate mică de material. De asta o biopsie mică e, de obicei, “de ajuns”.

Un vaccin personalizat (pe neoantigene) pune o întrebare mai mare – ce face ca tumora mea să arate diferit față de fiecare celulă sănătoasă din corpul meu? – iar răspunsul poate cere mult mai mult:

• Secvențierea întregului exom (toate genele care codifică proteine, nu o listă scurtă), ca să găsească mutațiile tumorii.
• Adesea, pe deasupra, secvențierea întregului transcriptom (ARN), ca să vadă care dintre acele mutații sunt de fapt pornite – și ca să prindă fuziunile genetice, exact acolo unde se află propria mea țintă.
• Iar mai multe centre preferă categoric țesutul proaspăt congelat în locul celui inclus în parafină, pentru că țesutul congelat păstrează ADN și ARN de calitate mai bună. Parafina (forma standard de arhivare) funcționează pentru multe teste, dar degradează materialul, iar unele fluxuri de fabricație a vaccinurilor nu o acceptă – sau au nevoie de mai multă, ca să compenseze.

Așa că exact analiza care proiectează vaccinul e pasul cel mai flămând de țesut din tot parcursul, și vine adesea ultimul – mult după biopsie, când materialul e deja rezervat.

Nu orice vaccin cere aceeași cantitate – asta e pârghia ta

Aici e partea utilă, lucrul care îți dă opțiuni chiar și când țesutul e puțin. Platforme diferite de vaccin au nevoie de cantități foarte diferite de țesut, pentru că își iau cele două ingrediente – celulele imunitare și ținta – din locuri diferite:

• Celulele. Unele vaccinuri (cele cu celule dendritice) cresc celulele imunitare din sângele tău, printr-o simplă recoltare de sânge sau o afereză. Niciun pic de țesut tumoral pentru partea asta.
• Ținta. Dacă mutațiile tumorii sunt deja cunoscute – dintr-o secvențiere pe care o ai deja – unele centre pot construi vaccinul din peptide definite (fragmente scurte care se potrivesc cu acele mutații), sintetizate chimic. Din nou, niciun țesut proaspăt necesar pentru partea asta.

Pune-le împreună și obții o distincție reală:

• Centrele care fac propria lor secvențiere a întregului exom + transcriptom din țesutul tău au nevoie de cel mai mult material – iar dacă ești pe puțin, s-ar putea să fie de neatins.
• Centrele care construiesc peptide definite din date pe care le ai deja, cu celule din sângele tău, au nevoie de puțin sau deloc țesut nou – și pot rămâne o opțiune chiar și când blocul e aproape gol.

Să știi din ce categorie face parte un centru înainte să angajezi bani e una dintre cele mai importante întrebări pe care le poți pune.

Ce aș întreba la prima biopsie, dacă aș putea s-o iau de la capăt

Nimic din toate astea nu-ți cere să fi decis deja pentru un vaccin. Doar ține ușa deschisă, ieftin, în singurul moment în care e deschisă:

1. Cere carote suplimentare. Una sau două treceri în plus, cât timp acul e deja acolo și tumora e activă, e tot jocul. E mult mai ușor decât o a doua procedură mai târziu.
2. Întreabă dacă o parte poate fi păstrată proaspăt congelată, nu doar fixată în parafină. Asta trebuie aranjat înainte de procedură – nu se poate face după.
3. Cere ca blocul de diagnostic să nu fie consumat complet de primul test – ca o parte din tumoră să fie păstrată pentru mai târziu.
4. Cere un inventar scris după fiecare test: câte secțiuni au mai rămas și ce procent e încă tumoră. “Țesutul e bun” și “mai e destul țesut” sunt două propoziții diferite, iar asta am învățat-o pe pielea mea.
5. Dacă boala ta e condusă de o fuziune, cere joncțiunea exactă (exonii și coordonatele), nu doar numele celor două gene – de obicei datele există deja în fișierele laboratorului.

Există o versiune mai amplă și mai așezată a acestei liste în ghidul nostru însoțitor, Conservarea țesutului tumoral – citește-o înainte de o biopsie, dacă poți.

Dacă ai trecut deja de momentul ăla

Și eu la fel. Nu e capătul drumului, doar îl îngustează:

• Folosește datele pe care le ai deja. Raportul molecular de la diagnostic conține deja cea mai mare parte din ce are nevoie un vaccin pe peptide definite. S-ar putea să nu ai deloc nevoie de o secvențiere nouă – ci doar de un centru dispus să lucreze pornind de la el.
• Preferă platformele pe sânge-și-peptide în locul celor flămânde de țesut. Spune-i fiecărui centru că țesutul tău e limitat și întreabă, direct, dacă pot proiecta pornind de la datele existente, cu celule din sângele tău.
• Pune deoparte la următoarea ocazie. Dacă boala progresează vreodată și apare o leziune nouă, biopsiabilă, ăla e momentul să recoltezi generos – inclusiv proaspăt congelat – pentru că s-ar putea să nu mai vină.
• Nu plăti în plus pentru o fundătură. Întreabă, în scris, ce se întâmplă cu banii tăi și cu datele tale dacă țesutul limitat se dovedește inutilizabil, înainte să transferi ceva.

De ce public asta

Am o strategie clară și nicio garanție, și am petrecut săptămâni ocolind o limitare pe care o singură propoziție la prima mea biopsie ar fi prevenit-o. Țesutul a fost acolo, cândva. Nimeni nu mi-a spus să păstrez mai mult din el, iar până să înțeleg de ce contează, tumora pe care aș fi recoltat-o dispăruse.

Dacă ești mai devreme în asta decât mine – dacă mai ai o biopsie în față, sau tumora e încă acolo, de recoltat – te rog cere mai mult decât minimul. Costă aproape nimic acum și poate valora totul mai târziu.